А я про гарантию и не пишу.
Контроль/замена фильтров входит в каждое регламентное ТО.
http://skoda-avto.ru/resource_10770.pdf
Отказавшись от контроля Вы этот регламент нарушаете.
В заказ-наряде строки контроля/замены фильтра нет.
Не документа - нет работы. Т.е. фильтр не проверялся/менялся.
Другое дело, что из-за фильтра мало чего может приключится и ОД просто закрывает на это глаза.